保护区属暖温带季风大陆性气候区。年均气温11.9℃，极端最高气温36.5℃，极端最低气温3.3℃。年均降水量567毫米，降雨年际变化大，年内分配不均，59%的降水集中在夏季，年日照时数2554小时，无霜期243天。春秋季多西南风、西北风，夏季盛行东南风，冬季以西北风为主，全年风速大于17米/秒的大风天有68天。

    长岛又称庙岛群岛、长山列岛，海岸线长约146千米，呈现明显的海蚀地貌景观，沿岛屿海岸形成99处海湾，其中28处已定名。主要由南北长山岛、南北隍城岛、大小黑山岛、大小钦岛和庙岛、高山岛、候矶岛、车由岛等32个岛屿组成（包括10个常住居民岛）。最大岛为南长山岛，面积12.75平方千米，最小岛为小高山岛，面积2400平方米。岛屿主要由长石石英岩、绢云母千枚岩及板岩等构成。地貌以低山丘陵为主，有40多座山头海拔在百米以上，最高点高山岛，海拔202.8米；最低点东嘴石岛，海拔7.2米。众多岛屿南北向排布，纵贯渤海海峡南部，占据了海峡3/5的海面，以北砣矶水道、长山水道为界，分为北、中、南3岛群。南岛群地势平缓，多砂滩、石滩；中、北岛群地势高陡，多岩岸。湿地土壤棕壤土为地带性土壤，主要分布在岛屿中上部；岛屿下部分布有褐土；大多数岛局部覆盖有第四系黄土。30厘米以下的薄土层有2.1平方千米，31厘米厚的中土层约1.33平方千米，60厘米以上的厚层土约4.66平方千米。(未完待续。)